Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OxsmQ9D404 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OxsmQ9D404 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
OxsmQ9D404 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OxsmQ9D404 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
OxsmQ9D404 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OxsmQ9D404 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms