Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpn3Q9D3W4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpn3Q9D3W4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpn3Q9D3W4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpn3Q9D3W4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpn3Q9D3W4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpn3Q9D3W4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpn3Q9D3W4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpn3Q9D3W4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpn3Q9D3W4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpn3Q9D3W4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpn3Q9D3W4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.9 ms