Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933436I01RikQ9D3T1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
4933436I01RikQ9D3T1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933436I01RikQ9D3T1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4933436I01RikQ9D3T1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933436I01RikQ9D3T1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933436I01RikQ9D3T1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933436I01RikQ9D3T1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933436I01RikQ9D3T1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933436I01RikQ9D3T1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933436I01RikQ9D3T1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933436I01RikQ9D3T1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933436I01RikQ9D3T1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933436I01RikQ9D3T1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933436I01RikQ9D3T1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933436I01RikQ9D3T1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms