Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G9

Rhoh, Rho-related GTP-binding protein RhoH, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhohQ9D3G9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhohQ9D3G9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RhohQ9D3G9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhohQ9D3G9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhohQ9D3G9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RhohQ9D3G9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhohQ9D3G9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhohQ9D3G9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhohQ9D3G9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms