Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Krt20Q9D312 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Krt20Q9D312 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Krt20Q9D312 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Krt20Q9D312 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Krt20Q9D312 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Krt20Q9D312 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Krt20Q9D312 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Krt20Q9D312 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Krt20Q9D312 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Krt20Q9D312 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Krt20Q9D312 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Krt20Q9D312 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Krt20Q9D312 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Krt20Q9D312 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Krt20Q9D312 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Krt20Q9D312 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Krt20Q9D312 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Krt20Q9D312 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Krt20Q9D312 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Krt20Q9D312 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Krt20Q9D312 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Krt20Q9D312 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Krt20Q9D312 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms