Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd39Q9D2X0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd39Q9D2X0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd39Q9D2X0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd39Q9D2X0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms