Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chordc1Q9D1P4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Chordc1Q9D1P4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chordc1Q9D1P4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chordc1Q9D1P4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chordc1Q9D1P4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chordc1Q9D1P4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chordc1Q9D1P4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chordc1Q9D1P4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chordc1Q9D1P4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chordc1Q9D1P4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chordc1Q9D1P4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chordc1Q9D1P4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms