Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Susd3Q9D176 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Susd3Q9D176 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Susd3Q9D176 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Susd3Q9D176 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Susd3Q9D176 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Susd3Q9D176 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Susd3Q9D176 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Susd3Q9D176 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Susd3Q9D176 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Susd3Q9D176 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Susd3Q9D176 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Susd3Q9D176 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Susd3Q9D176 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Susd3Q9D176 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Susd3Q9D176 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Susd3Q9D176 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Susd3Q9D176 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Susd3Q9D176 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Susd3Q9D176 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Susd3Q9D176 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Susd3Q9D176 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Susd3Q9D176 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Susd3Q9D176 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Susd3Q9D176 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Susd3Q9D176 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Susd3Q9D176 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Susd3Q9D176 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Susd3Q9D176 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,95■■□□□ 1,75
Susd3Q9D176 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Susd3Q9D176 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Susd3Q9D176 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,9 ms