Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hddc3Q9D114 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hddc3Q9D114 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hddc3Q9D114 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hddc3Q9D114 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hddc3Q9D114 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hddc3Q9D114 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hddc3Q9D114 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hddc3Q9D114 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hddc3Q9D114 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hddc3Q9D114 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hddc3Q9D114 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hddc3Q9D114 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hddc3Q9D114 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hddc3Q9D114 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hddc3Q9D114 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hddc3Q9D114 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hddc3Q9D114 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hddc3Q9D114 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hddc3Q9D114 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms