Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arv1Q9D0U9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arv1Q9D0U9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Arv1Q9D0U9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arv1Q9D0U9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arv1Q9D0U9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arv1Q9D0U9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arv1Q9D0U9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Arv1Q9D0U9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arv1Q9D0U9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arv1Q9D0U9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arv1Q9D0U9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arv1Q9D0U9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arv1Q9D0U9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arv1Q9D0U9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms