Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spc24Q9D083 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spc24Q9D083 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spc24Q9D083 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spc24Q9D083 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spc24Q9D083 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spc24Q9D083 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Spc24Q9D083 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spc24Q9D083 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spc24Q9D083 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spc24Q9D083 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spc24Q9D083 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spc24Q9D083 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spc24Q9D083 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spc24Q9D083 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spc24Q9D083 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spc24Q9D083 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spc24Q9D083 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spc24Q9D083 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Spc24Q9D083 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spc24Q9D083 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spc24Q9D083 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spc24Q9D083 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms