Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mdm1Q9D067 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdm1Q9D067 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mdm1Q9D067 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdm1Q9D067 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdm1Q9D067 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdm1Q9D067 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mdm1Q9D067 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdm1Q9D067 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdm1Q9D067 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdm1Q9D067 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdm1Q9D067 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mdm1Q9D067 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdm1Q9D067 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdm1Q9D067 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdm1Q9D067 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdm1Q9D067 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdm1Q9D067 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdm1Q9D067 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdm1Q9D067 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdm1Q9D067 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdm1Q9D067 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdm1Q9D067 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdm1Q9D067 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdm1Q9D067 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdm1Q9D067 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdm1Q9D067 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdm1Q9D067 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms