Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmss1Q9CZT6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmss1Q9CZT6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cmss1Q9CZT6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmss1Q9CZT6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cmss1Q9CZT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms