Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtm6Q9CZ69 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtm6Q9CZ69 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cmtm6Q9CZ69 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtm6Q9CZ69 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm6Q9CZ69 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm6Q9CZ69 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms