Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prelid3bQ9CYY7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prelid3bQ9CYY7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prelid3bQ9CYY7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prelid3bQ9CYY7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prelid3bQ9CYY7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prelid3bQ9CYY7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prelid3bQ9CYY7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prelid3bQ9CYY7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prelid3bQ9CYY7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prelid3bQ9CYY7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prelid3bQ9CYY7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prelid3bQ9CYY7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prelid3bQ9CYY7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prelid3bQ9CYY7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prelid3bQ9CYY7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prelid3bQ9CYY7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prelid3bQ9CYY7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prelid3bQ9CYY7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prelid3bQ9CYY7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prelid3bQ9CYY7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prelid3bQ9CYY7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms