Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hdhd3Q9CYW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hdhd3Q9CYW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdhd3Q9CYW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hdhd3Q9CYW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hdhd3Q9CYW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hdhd3Q9CYW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hdhd3Q9CYW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms