Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2fQ9CY34 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fQ9CY34 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2fQ9CY34 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2fQ9CY34 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Ube2fQ9CY34 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2fQ9CY34 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2fQ9CY34 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2fQ9CY34 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.2 ms