Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmem175Q9CXY1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem175Q9CXY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem175Q9CXY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem175Q9CXY1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem175Q9CXY1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmem175Q9CXY1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem175Q9CXY1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem175Q9CXY1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem175Q9CXY1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms