Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Yif1bQ9CX30 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yif1bQ9CX30 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Yif1bQ9CX30 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yif1bQ9CX30 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yif1bQ9CX30 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yif1bQ9CX30 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yif1bQ9CX30 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Yif1bQ9CX30 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yif1bQ9CX30 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yif1bQ9CX30 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yif1bQ9CX30 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Yif1bQ9CX30 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Yif1bQ9CX30 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms