Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NubplQ9CWD8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NubplQ9CWD8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NubplQ9CWD8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NubplQ9CWD8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NubplQ9CWD8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NubplQ9CWD8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NubplQ9CWD8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NubplQ9CWD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NubplQ9CWD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NubplQ9CWD8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NubplQ9CWD8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NubplQ9CWD8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NubplQ9CWD8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NubplQ9CWD8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NubplQ9CWD8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NubplQ9CWD8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NubplQ9CWD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NubplQ9CWD8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NubplQ9CWD8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NubplQ9CWD8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NubplQ9CWD8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NubplQ9CWD8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NubplQ9CWD8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NubplQ9CWD8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NubplQ9CWD8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NubplQ9CWD8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NubplQ9CWD8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NubplQ9CWD8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NubplQ9CWD8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NubplQ9CWD8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NubplQ9CWD8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NubplQ9CWD8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NubplQ9CWD8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NubplQ9CWD8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms