Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930519P11RikQ9CUJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519P11RikQ9CUJ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4930519P11RikQ9CUJ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms