Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smc1aQ9CU62 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smc1aQ9CU62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smc1aQ9CU62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smc1aQ9CU62 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smc1aQ9CU62 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smc1aQ9CU62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smc1aQ9CU62 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smc1aQ9CU62 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smc1aQ9CU62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Smc1aQ9CU62 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smc1aQ9CU62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smc1aQ9CU62 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smc1aQ9CU62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smc1aQ9CU62 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smc1aQ9CU62 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms