Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd1bQ9CSU0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1bQ9CSU0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rprd1bQ9CSU0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd1bQ9CSU0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd1bQ9CSU0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms