Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NmbQ9CR53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NmbQ9CR53 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NmbQ9CR53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NmbQ9CR53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbQ9CR53 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms