Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ska2Q9CR46 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ska2Q9CR46 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ska2Q9CR46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ska2Q9CR46 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ska2Q9CR46 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ska2Q9CR46 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ska2Q9CR46 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms