Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4931417E11RikQ9CR05 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4931417E11RikQ9CR05 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4931417E11RikQ9CR05 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931417E11RikQ9CR05 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931417E11RikQ9CR05 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931417E11RikQ9CR05 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms