Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr3kQ9CQZ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr3kQ9CQZ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3kQ9CQZ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3kQ9CQZ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms