Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Atg12Q9CQY1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21,18■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,98
Atg12Q9CQY1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21,13■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Atg12Q9CQY1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Atg12Q9CQY1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Atg12Q9CQY1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Atg12Q9CQY1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Atg12Q9CQY1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Atg12Q9CQY1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Atg12Q9CQY1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,6 ms