Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW2

Arl8b, ADP-ribosylation factor-like protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl8bQ9CQW2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arl8bQ9CQW2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arl8bQ9CQW2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arl8bQ9CQW2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arl8bQ9CQW2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arl8bQ9CQW2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arl8bQ9CQW2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Arl8bQ9CQW2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Arl8bQ9CQW2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arl8bQ9CQW2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arl8bQ9CQW2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arl8bQ9CQW2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arl8bQ9CQW2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arl8bQ9CQW2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arl8bQ9CQW2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arl8bQ9CQW2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arl8bQ9CQW2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arl8bQ9CQW2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arl8bQ9CQW2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arl8bQ9CQW2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arl8bQ9CQW2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms