Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riok2Q9CQS5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok2Q9CQS5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok2Q9CQS5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Riok2Q9CQS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok2Q9CQS5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riok2Q9CQS5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms