Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp5f1Q9CQQ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp5f1Q9CQQ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp5f1Q9CQQ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp5f1Q9CQQ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5f1Q9CQQ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5f1Q9CQQ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5f1Q9CQQ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5f1Q9CQQ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5f1Q9CQQ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms