Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl20Q9CQL4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl20Q9CQL4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl20Q9CQL4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl20Q9CQL4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms