Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC4

Tmem216, Transmembrane protein 216, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem216Q9CQC4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem216Q9CQC4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem216Q9CQC4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem216Q9CQC4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem216Q9CQC4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem216Q9CQC4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem216Q9CQC4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem216Q9CQC4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms