Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nudcd2Q9CQ48 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd2Q9CQ48 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nudcd2Q9CQ48 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nudcd2Q9CQ48 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nudcd2Q9CQ48 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nudcd2Q9CQ48 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nudcd2Q9CQ48 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd2Q9CQ48 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nudcd2Q9CQ48 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd2Q9CQ48 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nudcd2Q9CQ48 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nudcd2Q9CQ48 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms