Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4921530L21RikQ9CQ47 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4921530L21RikQ9CQ47 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4921530L21RikQ9CQ47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms