Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl49Q9CQ40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl49Q9CQ40 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl49Q9CQ40 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl49Q9CQ40 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl49Q9CQ40 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl49Q9CQ40 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl49Q9CQ40 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl49Q9CQ40 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl49Q9CQ40 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl49Q9CQ40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl49Q9CQ40 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl49Q9CQ40 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl49Q9CQ40 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl49Q9CQ40 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl49Q9CQ40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms