Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rwdd4Q9CPR1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rwdd4Q9CPR1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms