Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim3Q99PE5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smim3Q99PE5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim3Q99PE5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim3Q99PE5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim3Q99PE5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim3Q99PE5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms