Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms