Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2ird2Q99NI3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gtf2ird2Q99NI3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2ird2Q99NI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf2ird2Q99NI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2ird2Q99NI3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2ird2Q99NI3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2ird2Q99NI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2ird2Q99NI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2ird2Q99NI3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2ird2Q99NI3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2ird2Q99NI3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2ird2Q99NI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2ird2Q99NI3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms