Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl1Q99N96 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl1Q99N96 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrpl1Q99N96 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl1Q99N96 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl1Q99N96 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl1Q99N96 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrpl1Q99N96 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl1Q99N96 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl1Q99N96 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms