Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mccc1Q99MR8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mccc1Q99MR8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Mccc1Q99MR8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mccc1Q99MR8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mccc1Q99MR8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mccc1Q99MR8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mccc1Q99MR8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mccc1Q99MR8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mccc1Q99MR8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mccc1Q99MR8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mccc1Q99MR8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mccc1Q99MR8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mccc1Q99MR8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mccc1Q99MR8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mccc1Q99MR8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mccc1Q99MR8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mccc1Q99MR8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mccc1Q99MR8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms