Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tm2d1Q99MB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tm2d1Q99MB3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tm2d1Q99MB3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tm2d1Q99MB3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tm2d1Q99MB3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tm2d1Q99MB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm2d1Q99MB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tm2d1Q99MB3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tm2d1Q99MB3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tm2d1Q99MB3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tm2d1Q99MB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms