Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnaja3Q99M87 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaja3Q99M87 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnaja3Q99M87 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnaja3Q99M87 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaja3Q99M87 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja3Q99M87 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms