Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2nlQ99LJ0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2nlQ99LJ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms