Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsl24d1Q99L28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsl24d1Q99L28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsl24d1Q99L28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsl24d1Q99L28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rsl24d1Q99L28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsl24d1Q99L28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms