Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmp1Q99KU0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmp1Q99KU0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmp1Q99KU0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmp1Q99KU0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmp1Q99KU0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmp1Q99KU0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmp1Q99KU0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmp1Q99KU0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmp1Q99KU0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmp1Q99KU0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmp1Q99KU0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmp1Q99KU0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmp1Q99KU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms