Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clint1Q99KN9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clint1Q99KN9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clint1Q99KN9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clint1Q99KN9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clint1Q99KN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clint1Q99KN9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms