Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk9Q99J95 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk9Q99J95 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk9Q99J95 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk9Q99J95 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk9Q99J95 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk9Q99J95 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms