Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Dhx58Q99J87 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dhx58Q99J87 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dhx58Q99J87 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dhx58Q99J87 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dhx58Q99J87 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dhx58Q99J87 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dhx58Q99J87 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dhx58Q99J87 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dhx58Q99J87 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx58Q99J87 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx58Q99J87 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx58Q99J87 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx58Q99J87 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Dhx58Q99J87 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dhx58Q99J87 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dhx58Q99J87 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dhx58Q99J87 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dhx58Q99J87 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dhx58Q99J87 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dhx58Q99J87 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dhx58Q99J87 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dhx58Q99J87 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms